Collegium Medicum Uniwersytetu Zielonogórskiego prowadzi kształcenie na kierunkach studiów w oparciu o bazę własną, bazę ogólnouczelnianą, Szpital Uniwersytecki oraz bazę zewnętrzną tzw. bazę obcą na podstawie porozumień i umów zawartych pomiędzy Rektorem Uniwersytetu Zielonogórskiego a dyrektorami jednostek medycznych.
Wykłady z grupy przedmiotów: nauki morfologiczne, naukowe podstawy medycyny, nauki behawioralne i społeczne są realizowane w budynkach dydaktycznych A2, A29, lektoraty z języka angielskiego medycznego w budynku A2. Ponadto do dyspozycji grup seminaryjnych są sale w budynku A2, A6, A29. Wszystkie sale wyposażone są w ekrany i rzutniki multimedialne.
Głównym miejscem realizacji zajęć przedklinicznych, klinicznych, praktycznych i praktyk studenckich dla wszystkich kierunków medycznych Collegium Medicum jest Szpital Uniwersytecki. im. Karola Marcinkowskiego w Zielonej Górze utworzony w dniu 19 czerwca 2017 r. Szpital Uniwersytecki jest też miejscem odbywania praktyk wakacyjnych. W grudniu 2020r. oddano do użytku nowy budynek szpitala - Centrum Zdrowia Matki i Dziecka z przeznaczeniem również do zadań dydaktycznych dla studentów Collegium Medicum Uniwersytetu Zielonogórskiego.
Znaczna część zajęć odbywa się również w jednostkach zewnętrznych, z którymi Uczelnia ma podpisane porozumienia o współpracy. W części tych placówek utworzono oddziały kliniczne.
Zewnętrzną bazę kliniczną stanowią
1) Wielospecjalistyczny Szpital w Gorzowie Wielkopolskim
- Klinika Hematologii, Onkologii i Radioterapii z Pododdziałem Chemioterapii
- Kliniczny Zakład Medycyny Nuklearnej z Pracownią PET/CT
2) Wielospecjalistyczny Szpital w Nowej Soli
- Oddział Chorób Wewnętrznych
- Kliniczny Oddział Kardiologiczny
- Oddział Rehabilitacji
3) Samodzielny Publiczny Zakład Opieki Zdrowotnej w Sulechowie
- Oddział Kliniczny Endoskopii Ginekologicznej i Położnictwa
- Oddział Kliniczny Chirurgii Ogólnej i Onkologicznej
4) Dolnośląskie Centrum Chorób Serca Medinet oddział w Nowej Soli
- Oddział Kliniczny Kardiochirurgii
5) Szpital na Wyspie w Żarach
- Oddział Dziecięcy
6) Wojewódzki Szpital Specjalistyczny dla Nerwowo i Psychicznie Chorych w Ciborzu
7) Samodzielny Publiczny Zakład Opieki Zdrowotnej Centrum Leczenia Dzieci i Młodzieży w Zaborze
8) Lubuskie Centrum Ortopedii im. dr. Lecha Wierusza w Świebodzinie
9) Wojewódzka Stacja Pogotowia Ratunkowego w Zielonej Górze
10) Hospicjum im. Lady Ryder w Zielonej Górze
11) Centrum Medyczne Aldemed w Zielonej Górze
12) Przychodnia Lekarska „Skarbowa” w Zielonej Górze
13) Przychodnia Rodzinna „Batorego” w Zielonej Górze
14) Dom Pomocy Społecznej w Zielonej Górze
15) Dom Pomocy Społecznej dla Kombatantów w Zielonej Górze
Collegium Medicum współpracuje z wieloma jednostkami medycznymi w województwie lubuskim, w których studenci na zasadzie porozumień odbywają praktyki śródroczne i praktyki wakacyjne. Wśród nich wymienić można:
Wydział Lekarski i Nauk o Zdrowiu Collegium Medicum wykorzystuje bazę dydaktyczną innych wydziałów UZ: